明代宫廷制度中，有一种很特别的制度，即北京与南京各设六司，并由六司共同负责行政事务。所以，在朝堂上，才会有两位“礼部尚书”。
李自成即将攻打北京的时候，明王朝的官员也曾经向皇帝提议，让皇帝搬到南京去，毕竟那里已经建立起一个非常完善的机构。由此可见，这两大“六部”，从某种意义上来说，确实是大明王朝保障政权运行的“底牌”之一。
1368年，朱元璋在建都南京的同时，又把“北京”改成了开封，这就是明代“两京制”的初步形成。然而，当朱元璋设立两京之后，却发现开封不但无济于事，而且还存在着体制上的缺陷，于是就取消了这个决议。
朱棣于靖难之战后于南京即位，成为新的皇帝。不过，朱棣在南京没有什么靠山，建文帝的那些老部下又对他虎视眈眈，于是，朱棣不得不故技重施，用朱元璋的“两京制”，把大明的首都定在北京，“留都”定在南京。
朱棣在保持南京行政体制的同时，又对其进行了授权，以“六部制度”为典。南京六府所辖区域，并不局限于一地，还涵盖了江南诸州。就像是吏部，掌管着周围诸州的官员考核，户部和工部掌管着这一带的赋税和修建。
而军中的职能相对较弱，军中只是负责区域防御，并不参与整个国家的总体策略。刑部唯一的职责，就是维持当地的秩序。只有南京的礼部空闲着，几乎什么都不干。
本来，在南京做个官员，应该是一种很快乐的生活。大明北方不是很平静，到处都是战争，相比之下，南方就平静多了。而且，因为官职相同，南京六部的官员俸禄也不会太低。
不过，这种在别人看来很轻松，很赚钱的工作，对于明朝的文武百官来说，就是一种“恐惧”。南京在明代的时候，就被官府设置成了“养老院”，那些惹恼了皇上，或者有本事“难堪大用”的老臣，都会被送到南京。
而对这些青年才俊们而言，去南京当官，便代表着他们将永远离开权利的核心，将会在遥远的天涯海角度过一生，他们的政治生涯会就此终结。至于这些在朝堂上摸爬滚打的人，如果不能光荣退休，反而被发配到别的地方当官，那对他们来说，简直是莫大的羞辱。
