如果您有了正确的方向和可行的假设，您的研究就成功了一半。现在讨论这个似乎比较可笑，因为我们都是已经受过良好训练的“科研人员”。是的，在学生时代，我们在真正开始实验之前，就被训练着花费数月的时间寻找相关参考文献，用以准备一篇本研究领域的综述。
我们都明白，一个好的实验前提，对文稿最终的发表影响力有多么重要，但是在实验、数据收集整理和论文的撰写中，大家仍旧经常忽略研究的立意。
对于生物医学类的研究，不论涉及到基础研究还是临床研究，以下几点意见都可供您在提出实验假设时进行参考：
1）关注风险因子介导的基因突变。例如：吸烟与肺癌有关，我们就可以假设烟草致癌物会导致基因突变（序列的变异，甲基化和其他表观遗传的改变）；
2）关注信号通路上的基因改变。例如：肺癌患者中p53经常有变化，那么肺癌的致病过程中，在p53上游或者下游的基因是如何变化的？
3）关注基因或者药物在特异疾病或组织中的作用机制。例如：我们知道一个基因突变或者一个药物对某种疾病有效，那么我们就需要了解为什么有效和如何生效。而这个理由也特别适合对GWAS分析文章后续的深入研究。
总之大家要记住：不论写哪方面的文章，都需要有坚实的研究依据。换句话说，我们需要指出我们做这个实验的原因，希望得到什么样的结论。以下是作者叙述实验依据中不合格的例子：
因为这个基因在某种癌症中表达正常，但是在另一种癌症中还尚无研究，所以我们进行了如下实验。不合格！
一个基因在某种癌细胞凋亡的调控中起到重要作用，但在其他的癌症中作用尚不知，所以我们进行了这个研究。不合格！
在某种癌症中一个基因突变了，但我们想研究一下在其他癌症中，这个基因是否会突变。不合格！
