上海医药高等专科学校于2005年9月经上海市人民政府批准正式建校。学校坚持“以服务为宗旨、以就业为导向”的办学理念，探索“工学结合”的相关医学类专业人才培养模式，扎实推进“校企（院）合作、产学一体化”的办学模式和发展道路。学校聚焦国际先进标杆，引入国际行业标准，加强教学内涵建设，形成了国际化合作办学特色。
上海医药高等专科学校前身是上海第二医科大学卫生技术学院，成立于1999年，是上海市培养医学相关类卫生专业技术人才的重要基地，于2003年由上海市教委审批成为上海市示范性高等职业技术建设院校。学校以护理学为龙头专业，被教育部确定为上海市医学类高职院校中惟一的国家“技能型紧缺人才培养培训工程”点建设基地。护理学(中美合作)专业也是上海市教委批准的中外合作教学项目。
学校紧跟社会经济的发展，力求满足医疗卫生事业对卫生职业技术人才的需求。目前开设的专业有护理学、护理学(中美合作)、护理学（口腔卫生）、护理学（助产）、医学检验、口腔医学技术（口腔工艺技术）、药学、眼视光技术、医学影像技术、医学营养（食品卫生）、药学、市场营销（医药营销）和计算机技术及应用等专业还有2011年新开设的校医专业。
国家示范性高等职业院校重点建设专业：护理专业 医学检验技术专业 口腔医学技术（口腔工艺）专业 眼视光技术专业 药学专业
