牙齿酸痛不是某一种具体的疾病，而是一种过敏症状，引发的原因有很多，常见的主要有以下3个方面。
1、牙齿磨损导致牙齿酸痛：
牙齿颈部的磨耗，不当的刷牙方式，尤其是横刷，加上硬毛的牙刷和粗颗粒的牙粉，几十年累积下来的结果。在日常的门诊中，约有八成以上的患者或多或少都有这种齿颈部的磨耗。虽然它和蛀牙的形成原因不同，但是造成酸痛的机制却是一样的。
另外还有长期磨牙或不当咬合导致的合面磨耗等。
2、牙釉质遭受破坏导致牙齿酸痛：
牙釉质遭受破坏会导致牙本质暴露，当受到温度(冷、热)、化学的(酸、碱)和机械的(刷牙、咬硬物)等刺激时，所引起的异常酸痛的感觉。这种敏感，常由于磨耗、楔状缺损、酸蚀或外伤等使釉质缺损，使牙本质暴露造成。
3、口腔疾病导致牙齿酸痛：
由于长期的牙龈炎或者牙周病导致牙龈退缩或者牙齿松动，牙龈退缩后牙颈部比较敏感，会有冷热刺激的不适，牙周病由于牙齿松动会有牙齿的咬合无力及酸软的感觉.另外约有一部分的人在洗牙后或牙周手术后会有短暂性的敏感现象。这是因为做牙根整平术后，牙本质露出所造成的，不过后者大部份都是短暂性的，只要能维持口腔的清洁，大部分会自行消除。
当然，人体是一个复杂的综合体，完全的单因素疾病相对少见，而牙本质过敏症也同样十分复杂，临床中有些患者的牙齿牙本质暴露明显，却无敏感症状，而部分患者牙本质暴露不明显，甚至釉质完整者却又有明显的敏感症状。有学者认为这可能是由于个体差异、疼痛阈值不同、刺激类型不同等有关。
有相关文献明，牙齿的敏感与否及程度如何，还与许多因素有关，如气候、环境变化，经期、孕期，神经衰弱、精神紧张，疲劳等。
